LC-MS液質聯用儀是絕大多數化學公司，科研單位都會用的儀器。它大大的提升了實驗員的效率，幫助實驗員快速判斷化合物合成狀態和分子量。LC-MS是HPLC和MS的結合，有兩者的功能，又沒有兩者精確。

液質聯用(LCMS):LC為液相色譜儀；MS為一種能夠生成離子，在氣態中根據質荷比的不同將其分離并進行檢測的儀器。

LCMS以液相色譜作為分離系統，質譜作為檢測系統，因而兼具有液相色譜高分離度與質譜高靈敏度的特點。

分析的樣品在質譜部分和流動相分離，被離子化后，經質譜的質量分析器將離子碎片按質量數分開，經檢測器得到質譜圖。 

原理：質譜分析是先將物質離子化，按離子的質荷比分離，然后測量各種離子譜峰的強度而實現分析目的的一種分析方法.以檢測器檢測到的離子信號強度為縱坐標，離子質荷比為橫坐標所作的條狀圖就是我們常見的質譜圖 。

相關概念

離子豐度（Abundance of ions）：檢測器檢測到離子信號強度。

相對離子豐度（Relative abundance of ions）：以質譜圖中指定質荷比范圍內最強峰（基峰）的強度為100%。其它離子峰對其歸一化所得到的強度。標準質譜圖均以離子相對豐度值為縱坐標。離子的豐度與物質的含量相關，因此是質譜定量的基礎。

EI：電子轟擊源質譜，常用于GC-MS系統。

API：大氣壓電離源質譜，常用于LC-MS系統。

MALDI：基質輔助激光解吸電離源質譜，常用于生物大分子分析。

HPLC：高效液相色譜法（High Performance Liquid Chromatography \ HPLC）又稱“高壓液相色譜”、“高速液相色譜”、“高分離度液相色譜”、“近代柱色譜”等。高效液相色譜是色譜法的一個重要分支，以液體為流動相，采用高壓輸液系統，將具有不同極性的單一溶劑或不同比例的混合溶劑、緩沖液等流動相泵入裝有固定相的色譜柱，在柱內各成分被分離后，進入檢測器進行檢測，從而實現對試樣的分析。

UPLC：超高效液相色譜（Ultra Performance Liquid Chromatography，UPLC）色譜理論認為提高色譜柱的效能（efficiency）就能增加儀器的解析度（resolution），而運用粒徑低于2μm的小顆粒無疑是增加效能的好方法。但減小固定相的粒度以增加色譜柱效能一直是色譜儀器科學的瓶頸，因為小顆粒不僅要求系統能承受高于目前極限壓力（比如6000psi/400bar），需要更小的系統體積（死體積），并且需要能適應可能只有幾秒峰寬的高速檢測器。

ESI：Electron Spray Ionization的縮寫，意思是電噴霧離子源，是質譜儀中較為常用的一種離子化方式。電噴霧離子源屬于一種軟電離源,能使大質量的有機分子生成帶多電荷的離子。

APCI：Atmospheric Pressure Chemical Ionization的縮寫，大氣壓化學電離源 APCI是20世紀90年代后使用的液相色譜和質譜聯用的接口技術之一。溶液在氣流作用下形成氣溶膠，蒸發，電暈放電使溶劑電離，電子轉移或電子捕獲，使樣品帶電。

看LCMS步驟

1）先看MS部分，看有沒有所要離子峰，并且要看清楚該化合物是否有MS信號，是否掩蓋周圍的峰。

2）再看HPLC部分，看含量有多少，并且要看清楚該化合物是否有強的HPLC信號，是否掩蓋周圍的峰。

3）兩者結合起來看，推測反應進行的程度和反應產生的雜質。

常見加合離子峰

[M+1]：加質子

[M+14]：羧酸與甲醇成酯

[M+18]：加NH4

[M+19]：加水（水合）

[M+23]：加鈉離子

[M+39]：加鉀離子

[M+42]：加乙腈

[M+64]：加乙腈加鈉離子（常見于SHIMADZU）

[2M+1]：二聚離子（兩分子公用一個正電子）

[2M+23]：二聚加鈉（兩分子公用一個正電子）

[M+2/2]：分子中有兩個叔氮，容易上兩個質子

[一系列相差42的峰]：可能為石蠟油污染

[一系列相差44的峰]：可能為聚乙二醇污染

[M-16]：脫NH3

[M-17]：脫水

[M-44]：羧酸和Cbz中常見，重排后脫CO2

[M-56]：Boc中常見，脫叔丁基

[M-100]：脫Boc

[M-H]：基本離子

[M+X]：X指溶劑或緩沖液中的陽離子

[M-H+S]：溶劑加合離子

[M+2）/2]：分子絡合兩個氫離子，半峰

負模式

[M-1]:M-H-

[M+X[:M+X-, X=溶劑或緩沖溶液的陰離子