流感病毒對熱比較敏感。當流感病毒被加熱到５６℃并持續３０分鐘，或者被加熱到６０℃并持續１０分鐘時就會喪失活性，如果被加熱到６５℃～７０℃時只要幾分鐘時間即喪失活性。但是，流感病毒對低溫的抵抗力較強，在有甘油保護的情況下可保持活力１年以上。紫外線也是流感病毒的“克星”，用紫外線直接照射病毒可以依次破壞其感染力、血凝素活性和神經氨酸酶活性。在陽光直射下流感病毒４０～４８小時即可失去活性，如果用紫外線直接照射流感病毒，可以迅速破壞其感染性。
另外，流感病毒對乙醚、氯仿、丙酮等有機溶劑也很敏感。常用消毒藥如福爾馬林、氧化劑、稀酸、脫氧膽酸鈉、羥胺、十二烷基硫酸鈉和銨離子、鹵素化合物(如漂白粉和碘劑)、重金屬離子等，都能迅速破壞其傳染性。