沼肥包括沼渣和沼液，其中既有速效成分，又有緩效成分，是一種緩速兼優的好肥料。施用沼肥不但節省化肥、農藥，還可增強作物抗旱、抗寒能力，提高幼苗的成活率，生產綠色食品。但施用沼肥要注意以下五點：
一、不要出池后立即施用。沼肥的還原性強，出池后的沼肥立即施用，會與作物爭奪土壤中的氧氣，影響種子發芽和根系發育，導致作物葉片發黃、凋萎。因此，沼肥出池后，一般先在儲糞池中存放5-7天后再施用；沼渣與磷肥按10：1的比例混合堆漚5-7天后施用，效果更佳。
二、不要不兌水直接噴施。沼液不兌水直接噴施在作物上，尤其是幼苗、嫩葉上，會使作物出現灼傷現象。沼液作葉面追肥時，總體原則是：幼苗、嫩葉期1份沼液加1―2份清水；夏季高溫，1份沼液加1份清水，氣溫較低，又是老葉時，可不必加水。
三、不要過量施用。施用沼肥的量不能太多，一般要比施用普通有機肥少。若盲目大量施用，會導致作物徒長，行間蔭蔽，造成減產。
四、不要與草木灰、石灰等堿性肥料混施。草木灰、石灰等堿性較強，與沼肥混合，會造成沼肥中氮肥的損失，降低肥效。
五、不要直接施于地表。沼肥宜采用穴施或條施，然后蓋土。