這也是使用滋補藥時要重視的問題，尤其是一些稀少貴重的藥品和一些需要常備的藥品更需倍加注意。倘若保管不好，就會使藥物發霉、變質、蟲蛀、泛油，從而影響療效或造成浪費，甚至用后發生新的病癥或中毒等。
預防藥物發霉的主要措施是保持藥物干燥，為此，要將藥物曬干或通風涼干，或放于干燥箱內，或用塑料袋封存。
防蟲蛀的方法較多，如用藥物熏殺法、密封法、冷藏法等。
防泛油的主要方法是干燥和遮光，有條件的則要降溫冷藏。
如何煎藥和服藥，這對補藥藥性的發揮和療效之好壞，也有非常密切的關系。
先談煎藥的方法：在用具選擇上，多用砂鍋陶煲，不用金屬器皿。原因在于一些金屬易與藥物中的某些成分發生化合反應，而使藥物變質或產生沉淀物。
煎液：常用自來水或清潔的井水、河水，用水多少，當以藥物完全浸泡、水過藥物一兩橫指為度。
火候：補藥一般都應文火煎煮，才能使有效成分充分煎出。
先后煎：貝殼類、骨質類藥物，應先煎半小時之后，才下其他藥物；如無先煎藥物，一般都是一劑藥物同時煎煮。
另煎和烊化：另煎是單獨煎煮、如人參等；烊化是將藥物放熱水或熱藥中溶化。
服藥的方法：每煎一次服一次，一天要煎三次，服三次。一般宜溫服。
