酵母菌不是分類學(xué)上的名詞，而是一個(gè)習(xí)慣上的名稱。現(xiàn)知酵母菌大約有39屬、370余種，分屬于子囊菌綱、擔(dān)子菌綱和半知菌綱三個(gè)類群。
大多數(shù)酵母菌為單細(xì)胞，一般呈卵圓形、圓形或圓柱形，細(xì)胞寬約1～5微米，長約5～30微米。有些酵母菌的細(xì)胞連在一起形成鏈狀，稱為假菌絲。
酵母菌與霉菌同屬真核微生物，細(xì)胞中有真正細(xì)胞核。細(xì)胞壁的主要成分為葡聚糖與甘露聚糖。
大多數(shù)酵母菌的菌落與細(xì)菌菌落相似，但較細(xì)菌菌落大而厚，菌落表面濕潤、粘稠、容易挑起，菌落顏色多呈乳白色，只有少數(shù)為紅色。