蘋果典型的缺硼癥狀是患縮果病。果實發病的表現有三種癥狀，即果皮軟木型、果心軟木型和銹果型。
果皮軟木型癥狀，一般在謝花后半月內發生，以果頂處發病最重，成長果實以綠色部分發病較重。病果初期表皮出現圓形水漬狀斑塊，皮下果肉細胞脫水，變成棕褐色，壞死呈海綿狀，病斑干縮凹陷，果小而畸形，常造成幼果大量脫落。
果心軟木型癥狀，自蘋果謝花后半月到采收前均會發生。果心軟木型病果內部由萼洼開始至果心線內外的細胞木栓化，變為褐色。病果著色較早，呈暗紅色，果型正常，果內維管束壞死，變成褐色，呈海綿狀。
疣狀銹果型癥狀，果實扁圓、畸形、果皮極厚，果面出現不規則的銹褐色癥狀突起，果肉松如海綿，風味極臊淡。
蘋果缺硼枝梢發病常表現為兩種癥狀：一種在早春發生，芽子多不萌發，或雖萌發但開綻后很快死亡。新梢從頂端枯死，有的一直死到多年生枝上。從枯死枝的下面又生出很多小枝，這些小枝又很快死去。此后，又萌生出很多小枝，呈掃帚狀。如此下去，數年內整株死亡。另一種在早春新梢剛開始生長或夏末發生，新梢頂端枯死以后，由腋芽生長的副梢節間極短，節上生長很多小而厚脆的葉子，成簇生狀。嚴重時可造成整株死亡。
缺硼蘋果新梢嫩葉葉脈兩側有不同程度的縐紋，葉肉有不同程度的褪綠現象，以后變成微黃色，葉緣周圍褪綠較重，葉片向反面彎曲。