由自身器官、組織體細胞所形成根系的砧木。因系母株的營養(yǎng)體繁殖而成，其遺傳性與親本相同，可保證砧木苗和果苗的一致性；但自根砧缺乏主根，根系分布較淺，固地性不強，對旱、澇、寒、風(fēng)等的抗性亦較差。因此，對氣候、土壤條件要求比較嚴(yán)格，且繁殖系數(shù)較低，自根砧常用于因?qū)嵣敝匙儺惔螅荒鼙３忠恢滦缘恼枘緲浞N，或種子稀少、種子發(fā)芽率低的樹種。
自根砧的繁殖，需要建立自根砧母本園，從母本園剪取插條進行扦插繁殖，或選建母本材料繁殖圃，圃內(nèi)就地將母株枝條壓倒進行壓條繁殖，培養(yǎng)出自根的砧苗，栽植于苗圃中的成苗培育區(qū)，供嫁接繁殖果苗利用。