核酸序列的一般分析流程

1.1 核酸序列的檢索
http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide

1.2 核酸序列的同源性分析
1.2.1 基于NCBI/Blast軟件的核酸序列同源性分析
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi
1.2.2 核酸序列的兩兩比較
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/bl2.html
1.2.3 核酸序列的批量聯網同源性分析(方案)

1.3 核酸序列的電子延伸
1.3.1 利用UniGene數據庫進行電子延伸(方案)
1.3.2 利用Tigem的EST Machine進行電子延伸
EST Extractor: http://gcg.tigem.it/blastextract/estextract.html
EST Assembly: http://www.tigem/ESTmachine.html
1.3.3 利用THC數據庫對核酸序列進行電子延伸
http://gcg.tigem.it/UNIBLAST/uniblast.html

1.4 核酸序列的開放閱讀框架分析
1.4.1基于NCBI/ORF finder的ORF分析
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html

1.5 基因的電子表達譜分析
1.5.1 利用UniGene數據庫進行電子表達譜分析（方案）
1.5.2利用Tigem的電子原位雜交服務器進行電子表達譜分析
http://gcg.tigem.it/INSITU/insitublast.html

1.6 核酸序列的電子基因定位分析
1.6.1 利用STS數據庫進行電子基因定位
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/sts/epcr.cgi
1.6.2 利用UniGene數據庫進行電子基因定位（方案）

1.7 cDNA的基因組序列分析
1.7.1 通過從NCBI查詢部分基因組數據庫進行基因組序列的分析(方案)
1.7.2 通過從NCBI查詢全部基因組數據庫進行基因組序列的分析
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/page.cgi?F=HsBlast.html&&ORG=Hs
1.7.3 通過從Sanger Centre查詢基因組數據庫進行基因組序列的分析
http://www.sanger.ac.uk/HGP/blast_server.shtml

1.8 基因組序列的初步分析
1.8.1 基因組序列的內含子/外顯子分析
http://www.bioscience.org/urllists/genefind.htm
1.8.2 基因組序列的啟動子分析
http://www-hgc.lbl.gov/projects/promoter.html

1.9核酸序列的注冊
1.9.1 EST序列的注冊(方案)
1.9.2 較長或全長cDNA序列的注冊(方案)
1.10待分析序列所對應的已知克隆的獲取
http://image.llnl.gov