自體分化 selfdifferentiation 對于胚或胚區的自體分化，W．Roux（1905）曾賦予了這樣的定義：一切決定因素均包含于其自體中的一種分化。而現在的實驗胚胎學，對自體分化的概念，主要是針對胚胎的一部分，特別是僅針對器官原基或預定的 發物質，即意味著不具來自其他胚區的形態形成影響，而是一個胚區單獨進行的一種分化。一般自體分化與其胚區的預定分化多相一致，例如將兩棲類中期神經胚的預定眼原基移植于另外胚的腹側，仍可形成眼原基；又分離兩棲類的
肢芽，在體外進行培養，則照樣可獲得肢的分化，這些都是與其原來的預定分化相一致的自體分化。從這些實驗來看，根據手術移植后的眼原基和肢芽的分化形成，則不難推測，正常的胚胎發育也是進行著自體分化的。因此對自體分化的研究，亦將成為探討胚區的決定和分離狀況的重要途徑。但另一方面，按上述自體分化的定義，也有與其理論的預定分化的意義不一致的自體分化，這種實例是不少的。