L-氨基酸氧化酶，存在于腎臟 肝臟 霉菌、蛇毒、細菌等中，為直接氧化L-氨基酸的需氧性脫氫酶。EC1．4．3．2．如果不存在過氧化氫酶，則以H2O2脫羧形成酮酸。
其輔酶是FMN或FAD。底物專一性廣泛，能很好地氧化亮氨酸、甲硫氨酸等，但不作用于天冬氨酸、谷氨酸、甘氨酸等。但是，鳥類肝臟的酶對堿性氨基酸具有專一性。不過，由于活性低，因此動物的酶對氨基酸代謝是否有意義尚屬疑問。但對L-α-羥酸的氧化活性強，也許有這方面的意義。蛇毒的酶分子量約13萬、含2分子的FAD。
D-氨基酸氧化酶。為氧化D-氨基酸生成酮酸的酶。EC1．4．3．3。
D-氨基酸＋O2→酮酸＋H2O2＋NN3以FAD為輔酶，廣泛存在于生物中。在動物的腎臟、肝臟中也常見，但其意義欠明。由于能很好地作用于D－α－羧酸，所以也可能是真正的底物。對D-脯氨酸作用最好，但也作用于其他許多氨基酸。豬腎臟的結晶酶分子量為11.5萬，含2分子的FAD。