認為生物各種族的系統關系有如樹狀，可用圖來表示其狀態，此稱為系統樹。由海克爾（E．H．Haeckel）所提倡的。他制成了動物界和植物界全部的系統樹，給予生物學者以很大的推動。由于其這一大膽的創舉，在其后的生物學的趨勢是，強烈感到對系統發生探索的困難，不論是對整個生物界或是關于其細節方面，是否能作為完整無誤的系統樹，抱有很大的懷疑。另外，也有的認為生物的系統關系不一定是樹狀的，把系統的圖解（diagram）稱作系統樹也是不恰當的。但是，時至今日仍繼續作出各種系統樹，并且已相當的普及，所以還不能說對樹狀的系統持否定意見的已得到支配的地位。
