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近幾年，棉花生產的比較效益逐年提高，但農業生產資料的投入成本也相應增加。其中，用于病蟲防治和化學除草的開支也不斷加大。從多年的調查情況來看，種植棉花的投入產出比值以1∶3比較合理，即投入1元可收入3元，高出這個比例說明效益更好，低于這個比例說明效益不佳。在種植棉花的農資開支中，現階段農藥的開支每畝大約80元，不少農戶的農藥開支每畝已超過100元。因此，在新的一年棉花生產工作中，我們必須努力抓好增產節支，特別是在病蟲防治上，我們應抓好基礎工作，開源節流。
所謂棉花病蟲防治的基礎工作，說到底就是在棉花播種之前抓好農業防治。農業防治抓好了，就能為棉花高產豐收打下良好的基礎。棉花生產的農業防治工作，一是抓好輪作換茬，二是深翻土壤，三是改善水系，四是增肥改土，五是凈化環境，這五個方面，均與預防棉花病蟲息息相關，現分述如后。
不少棉區年復一年地種植棉花，易產生連茬障礙，一是表現土壤缺乏某種元素，二是枯黃萎病菌殘存蔓延。采取輪作換茬可較好地緩解這些障礙，一是將棉花與豆科作物換茬，二是將棉花與水稻輪番種植，其間隔時間要達三年以上，在有條件的地方，實行這樣的輪作換茬是值得提倡的。
兩熟棉田在廣大棉區正在不斷擴大，為了棉花早發早熟，多數兩熟棉區都在前茬作物中，為棉花留下了預留棉行。抓住冬春的低溫時機，深翻預留棉行，一可疏松耕作層，增強土壤的通透性能；二可凍死部分越冬的害蟲；三可清除部分棉田雜草。
近幾年來棉區很多青壯年勞力外出打工，棉田水系有所失修，旱澇災害頻繁發生，特別是6～7月份，排水不良的棉田，常易誘發枯萎病，嚴重發病的棉田對棉花產量損失很大。因此，抓好棉田水系設施的完善，疏理棉田三溝，可降低地下水位，預防枯萎病發生，增強棉花抗病能力。
近幾年，在棉花施肥上，化肥當家的問題越來越突出，對棉花病害的抵御能力逐漸下降。增施有機肥，特別是增施合緣酵素菌生物有機復合肥、高能有機復合肥以及農家積造的各類農家肥，一可以有效地改善棉田土壤，提高保肥供肥能力；二可分泌有機酸抑制枯萎病，預防病害。同時，配施鉀肥，可以更有效地預防和大大減輕枯萎病的危害。
棉花的病蟲一可在棉田土壤中殘存，二可靠外界傳播。所以，除了以上四項預防措施外，必須要凈化棉田及周邊的環境。一是不斷清理田中雜草；二是撿除棉田土壤內的殘留塑料薄膜；三是鏟除棉田四周雜草，消除攜帶病蟲的棉株和棉殼。
