灰霉病病菌隨病殘體在土壤和病株上越冬，借助氣流、雨水、灌溉水傳播，進行初侵染和再侵染，溫度高時產生菌核越夏。該病為低溫高濕型病害，發病與溫濕度關系密切。溫度15-21℃、空氣相對濕度85%以上發病重，相對濕度低于60%發病輕或不發病。夜間韭菜受凍，白天高溫且濕度大，發病重。早春或秋末冬初遇連陰雨天氣，相對濕度在95%以上，病害易流行。

適時通風降濕，防止棚內濕度過大，是防治該病的關鍵。可以根據天氣情況在中午前后通風降濕，使棚內空氣相對濕度降到70%以下。通風量依韭菜長勢而定，不能放底風。對已發生病害的大棚，可在發病初期用藥防治。

目前國內登記用于防治韭菜灰霉病的藥劑主要是腐霉利制劑，如山西運城綠康實業有限公司（電話：0359-2581328）的熏克（15%腐霉利煙劑，每公頃純藥推薦用量450-750克）、山西廣大化工有限公司（電話：0359-6682303）的棚富（15%腐霉利煙劑，每公頃純藥推薦用量300-750克）、河南銀田精細化工有限公司（電話：0373-7275605）的棚清（15%腐霉利煙劑，每公頃純藥推薦用量562.5-787.5克）、北京晨陽植保制劑廠（電話：010-67783914，84311851）的灰核一熏凈（15%腐霉利煙劑，每公頃純藥推薦用量300-750克）和陜西兵器化工研制廠（電話：029-87518766）的勝德靈（50%腐霉利可濕性粉劑，每公頃純藥推薦用量300-450克），熏得利（15%腐霉利煙劑，每公頃純藥推薦用量525-750克）。其他還有山東德州大成農藥有限公司（電話：0534-2757586）的45%多·菌核可濕性粉劑（含多菌靈25%、菌核凈20%，每公頃純藥推薦用量375-450克）、天津市興果農藥廠（電話：022-86854568，86852977）的菜友樂（25%多·福·福鋅可濕性粉劑，含多菌靈5%、福美鋅10%、福美雙10%，每公頃純藥推薦用量312.5-375克）。

除了使用上述藥劑外，生產上還可以每畝用10%速克靈煙劑200-250克或45%百菌清煙劑250克于傍晚熏蒸；或者每畝用5%百菌清粉塵劑1公斤噴施；也可以用50%速克靈可濕性粉劑或50%撲海因可濕性粉劑1000-1500倍液噴霧。輪換交替使用不同的藥劑防治，每隔10天1次，連續防治2-3次。噴霧防治會提高棚內濕度，遇陰雨天棚內濕度難以迅速降低時宜選用熏煙、噴粉等方法。