食草家畜口服土霉素后，可引起兩方面的危害。

一、引起消化道機能和形態的改變。成年食食家畜以草料為主食，消化草料除了依靠消化液外，還要依靠胃腸中大量的微生物。口服土霉素后，胃腸中的微生物受到抑制或被殺死，即打亂正常的消化過程而發生消化紊亂。如羊口服土霉素后，可引起厭食、腹脹、前胃弛緩和腹瀉；家兔口服土霉素后，可引起腸黏膜壞死，腸上皮細胞脫落，腸黏膜下層充血和水腫。

二、使家畜發生“二重感染”，引起中毒而死亡。“二重感染”又叫“菌群交替癥”。動物肌體內存在著一定數量的細菌，其中有非致病菌，也有致病菌和條件致病菌。由于菌群之間存在著互相制約作用，在一般情況下，彼此之間可以和平共處，維持平衡共生狀態。口服土霉素后，敏感菌群受到抑制，耐藥菌群即因失去制約而趁機過度繁殖，對肌體造成嚴重的危害，這就叫作“二重感染”。如某農場的技術人員給成年牛、驢、騾治療胃腸卡他性炎癥時，牛與騾每頭口服12克土霉素，驢每頭口服8克。共治療牛9頭、騾8頭、驢2頭。服藥后引起“二重感染”，先后發生中毒，經多方搶救，只救活一部分，共死亡牛2頭、騾4頭、驢1頭。“二重感染”的病原菌，主要為金黃色葡萄球菌、真菌和腸道革蘭氏陰性桿菌。它們可引起腸炎、肺炎、尿路感染和敗血癥。此外，腸道內有許多細菌，具有合成B族維生素和維生素K的能力，可供給肌體維生素，對肌體有益，這類細菌受到抑制，則會引起維生素缺乏癥。