一. 原理

      離子交換色譜的固定相是交換劑，根據(jù)交換劑性質(zhì)可分為：

陽離子交換劑和陰離子交換劑。

    交換劑由固定的離子基團和可交換的平衡離子組成。當(dāng)流動相帶著組分離子通過離子交換柱時，組分離子與交換劑上可交換的平衡離子進行可逆交換，最后達到交換平衡，陰陽離子的交換平衡可表示為：

     陽離子交換：    R⁺Y^- + X^- = R⁺X^-+ Y^-

     陰離子交換：    R^-Y⁺ + X⁺ = R^-X⁺+ Y⁺

 R⁺ 、R^-—為交換劑上的固定離子基團，如RSO₃^-或RNH₃⁺；

 Y⁺、Y^-—為可交換的平衡離子，可以是H⁺、Na⁺或OH^-、Cl^-等

 X⁺ 、X^-—為組分離子。

    組分離子對固定離子基團的親和力強，分配系數(shù)大，其保留時間長；反之，分配系數(shù)小，其保留時間短；因此：

離子交換色譜：是根據(jù)不同組分離子對固定離子基團的親和力的差別而達到分離的目的。

二. 固定相

    離子交換色譜固定相：早期離子交換色譜法采用離子交換樹脂作為固定相，有溶脹和收縮現(xiàn)象，不耐高壓，而且表面微孔結(jié)構(gòu)影響傳質(zhì)，柱效低，現(xiàn)已被離子交換鍵合相所取代。

    離子交換鍵合相：是以薄殼型或全多孔微粒硅膠為載體，表面經(jīng)化學(xué)反應(yīng)鍵合上各種離子交換基團。若帶上磺酸基（－SO₃H 強酸性）、羧基（一COOH 弱酸性）就是陽離交換樹脂；若帶上季胺基（-NR₃Cl強堿性）或胺基（-NH₂弱堿性）就是陰離子交換劑。

（分離分析：核苷酸、碳水化合物、有機酸、蛋白質(zhì)、酶等）

三. 流動相

    離子交換色譜流動相：通常是鹽類的緩沖溶液。通過改變流動相的 pH、緩沖劑（平衡離子）的類型、離子強度以及加入有機溶劑、配位劑等都會改變交換劑的選擇性，影響樣品的分離效果。

    常用的緩沖劑有：磷酸鹽、乙酸鹽、檸檬酸鹽、甲酸鹽、氨水等。