1、高血壓咖啡中含有咖啡因，它能使部分敏感血壓升高。
2、腎衰竭腎衰竭患者若有高血鉀現象，需配合限鉀飲食，咖啡含鉀量高。
3、消化性潰瘍咖啡因刺激胃酸分泌，并使消化系統平滑肌血管松弛，加速食物的代謝，而降低食物的營養價值。
4、糖尿病咖啡因能降低胰臟中胰島素的分泌，降低葡萄糖的耐受量，增加胰島素的排泄而使血糖上升。
5、癲癇咖啡因能刺激腦動力中樞，黃口呤會使血管收縮，減少腦部血流量。對癲癇病患者十分不利。
6、心臟病咖啡會增加脂肪及甘油三酯的含量，增加心臟負擔及氧氣的消耗量。特別是當身體疲倦及吸煙過度時易引起。
7、缺鐵性貧血咖啡會加速食物的代謝而降低鐵的吸收率。
8、腎結石預防草酸鈣結石復發，須禁食富含草酸的食物，而咖啡即為含草酸豐富的食物。
9、失眠長期飲用咖啡會影響鎮靜作用，增加清醒次數，使睡眠深度變淺。除以上病患者不能飲用咖啡外，健康的人不一定都適合飲用咖啡，比如孕婦、哺乳期的婦女，運動員等飲用會產生不良感覺或病理現象。
