礦泉水含有多種對人體有益的物質和游離的二氧化碳，但如果飲用過多礦泉水，會影響胃液的分泌和胃的消化機能，還會影響膽汁的形成和分泌，從而導致人體內的酸堿失調。
由于礦泉水中含有較多的礦物質，過量飲用會使這些礦物質鹽刺激腎臟和膀胱，增加腎臟和膀胱的負擔。所以患有慢性腎炎、高血壓、心臟病及伴有浮腫的病人不宜飲用礦泉水，更不能將礦泉水當作治病的藥水服用。
適量的鈣攝入可以促進人的骨架、牙齒發育，增加細胞的通透性等，但是如果過量補充則會引起高鈣血癥，使人出現軟弱無力、食欲不振、嘔吐腹瀉等痛苦癥狀，而且過量的鈣可能導致腎結石，所以結石患者要少喝礦泉水；
鋅元素補充過多，不但會影響到身體其他微量元素的正常吸收和利用，而且還可能引起身體組織的損傷；
鐵元素攝入過量可能會引發肝硬化和糖尿病，急性鐵中毒者還會迅速休克，嚴重者甚至會有生命危險；
碘元素補充過量，則會出現脫發、指甲變脆、易疲勞、胃腸功能紊亂、浮腫、不育等癥狀。
此外，一些礦泉水中還含有極微量的鉛、汞、鎘等有毒有害元素，因此，作為生產企業，在積極開發多種礦泉水的同時，應當嚴格把關，最大限度地分離或除去有害微量元素。
